ASD 2015, 9ème édition de la Conférence sur les Avancées des Systèmes Décisionnels

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MOUKRANE BOUZGHOUB

Biography

Mokrane BOUZGHOUB is Currently full professor in Computer Science at the University of Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (since 1992).  Since december 2009,he is deputy director of INS2I (the CNRS National Institute of Informatics and its Interactions).Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines – CNRS INS2I Institut des Sciences de l'Information et de leurs Interactions

Titre: Le défi Mastodns, Une approche interdisciplinaire des Big Data

RIM MOUSSA

Biography
Rim Moussa received her Ph.D in Computer Science from University Paris IX Dauphine in 2004. She is currently in sabbatical leave from University of Carthage (ENICar) and invited researcher at Inria Sophia Antipolis Méditerranée (ZENITH team).  Her research interests include scalable and distributed computing systems and business intelligence systems.

 

Titre: Architectural advances in data warehouse systems

Summary

Big Data has become a hot topic in the last decade in both industry and research. Both the recognition of the fact that data is of big economic value and the significant achievements in low cost data storage and high performance parallel computing, foster new research directions in business intelligence fondamentals and technologies in order to extract knowledge from massive amounts of data. The talk is on Big Data new challenges and new opportunities. It presents architectural solutions and presenter experiences based on the Lambda Architecture that go beyond the limits of OLAP-like processing models and technologies, and which enable to build large-scale distributed data analytical systems. Talk

Ahmed Moussa

Ahmed Moussa received his MSc degree in Automatic Control from the University of Oujda, Morocco, in 1994, and his PhD in Data analysis and Information Theory from the University of Kenitra, Morocco, in 2001. He worked two years as a post-graduate researcher at the University of Sciences and Technology of Lille in Medical Image Analysis and for three years with the Sanofi-Aventis pharmaceutical research Group. Between 2006 an 2010 he worked as assistant professor in the National School of Applied Sciences in the Abdelmalek Essaadi University of Tangier Morocco. Since 2010 he has been an Associate Professor in Bioinformatics and data analysis, and the head of the Informatics and Complex Systems Master Degree. He is also the Principale Investigator of the Project 'Humain Heridity and Health in Africa'. His current research interests are in development of pipelines for NGS Data and MS Data analysis, development of new algorithms and tools for  selection and target identification related to some pathologies in Africa.

Titre: Big Bioinformatique Data: de l'acquisition à la distribution

Résumé :

La Bioinformatique, comme la plupart des disciplines scientifiques dépendantes des nouvelles technologies, est dans une ère où l’information est de plus en plus grande,  présentée sous de nombreuses formes et représentée à différents niveaux, y compris les niveaux génomique, transcriptomique, protéomique et métabolomique. Cette avalanche d’information, notamment génétique, est la conséquence des données générées par les centres de séquençage à grande échelle, des installations d'analyse à haut débit et les laboratoires publics et privés qui produisent de grandes quantités de données telles que les séquences nucléotidiques et protéiques, structures cristallines des protéines, des mesures d'expression des gènes, les protéines et les interactions génétiques. En Juillet 2008, plus de 18 millions d'articles ont été indexées dans PubMed et plus de 260.000 nouvelles séquences nucléotidiques d’organismes avaient été soumises à GenBank. Selon les estimations, en 2025 les Big-Data Bioinformatiques vont dépassés certains systèmes de générations de données de masses telques Twiter Youtube notamment aux niveaux stockage et Analyse [1].

Dans ce travail, et conscient par l’importance du domaine des Big Data en sciences de la vie, nous allons donner un aperçu traçant les nouvelles technologies utilisées au cours de la dernière décénie pour la génération de l’information génétique. L’accent sera mise sur les principales technologies de séquençage à haut débit à savoir les MicroArrays, les Séquenceurs Nouvelles Génération et les nouveaux Spectrometres de Masse. Nous allons abordé les questions relatives aux stockages de ces données, aux développments d’algorithmes efficaces de traitement et d’analyse de ces données, et aussi à l’integration des résultats aux bases de données (biocuration) [2]. Plusieurs pipelines d’analyse de ces données dévéloppé sur la plate forme Galaxy seront présentés, mettant l’accent ainsi sur l’intérêt du travail collaboratif qui devrais se mettre en place pour faciliter l’utilisation de ces  Big Data Bioinformatiques par les chercheurs entre autres, en médecine, biologie et/ou  pharmacie

 

 

 
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